- 操作系统支持:Windows,Linux 以及 OSX
- Python 版本:3.6, 3.7
| 名字 | 版本 |
|---|---|
| numpy | - |
| pandas | - |
| networkx | - |
| paddlepaddle | >=2.0.0rc0 |
| pgl | >=2.1 |
| rdkit | - |
(“-” 代表没有版本要求)
因为 PaddleHelix 安装包依赖于最新版的 paddlepaddle(2.0.0rc0 或以上),以及无法直接使用 pip 命令直接安装的 rdkit,因此我们建议创建一个新的 conda 环境,具体步骤如下:
-
如果你之前从来没有使用过 conda,可以参考这个网页来安装 conda:
https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/install/
-
在安装完 conda 之后, 可以开始创建一个新的 conda 环境:
conda create -n paddlehelix python=3.7- 使用如下命令激活 conda 环境:
conda activate paddlehelix- 在安装 PaddleHelix 之前,首先需要使用 conda 安装
rdkit:
conda install -c conda-forge rdkit-
基于你想在 CPU 或者 GPU 上运行 PaddleHelix 来选择安装不同版本的
paddlepaddle:比如,你想使用
paddlepaddle的 GPU 版本,你可以运行以下命令:python -m pip install paddlepaddle-gpu -f https://paddlepaddle.org.cn/whl/stable.html
或者你想使用
paddlepaddle的 CPU 版本,你可以运行以下命令:python -m pip install paddlepaddle -i https://mirror.baidu.com/pypi/simple
请注意安装
paddlepaddle2.0 以上版本,其他安装方法参见paddlepaddle官方文档。 -
使用 pip 命令安装
PGL:
pip install pgl- 使用 pip 命令安装 PaddleHelix
pip install paddlehelix- 等待 PaddleHelix 安装完成!
运行完项目之后,如果想要退出当前 conda 环境,可以使用下列命令:
conda deactivate