Shiny Portal

一个基于 Docker 的 Shiny Server 环境，支持自动化的依赖管理。

特点

• 使用 rocker/shiny-verse 作为基础镜像，预装常用 R 包
• 自动化依赖安装（支持 CRAN、GitHub、Bioconductor）
• R 包持久化到本地目录
• 以 shiny 用户运行应用，更安全

快速开始

前置要求

• Docker
• Docker Compose

启动服务

docker compose up -d

访问 Shiny Server

打开浏览器访问：http://localhost:3838

项目结构

shiny-portal/
├── apps/              # Shiny 应用目录
├── conf/              # Shiny Server 配置
├── logs/              # 日志目录
├── r-libs/            # 持久化的 R 包
├── scripts/           # 初始化和依赖管理脚本
│   ├── dependencies.R # 依赖配置文件
│   ├── init.sh        # 初始化脚本
│   └── README.md      # 详细使用说明
└── docker-compose.yml # Docker Compose 配置

如何添加依赖

编辑 scripts/dependencies.R 文件：

# CRAN 包
cran_packages <- c(
  "ggplot2",
  "dplyr"
)

# GitHub 包 (格式: username/repo)
github_packages <- c(
  "tidyverse/ggplot2"
)

# Bioconductor 包
bioconductor_packages <- c(
  "Biobase"
)

添加后重启容器：

docker compose down && docker compose up -d

更多文档

详细的使用说明请参考：scripts/README.md

License

MIT